Στην επόμενη φάση του Κυπέλλου Ελλάδας προκρίθηκε η ΑΕΛ χωρίς αγώνα μετά την κλήρωση που διεξήχθη την Τρίτη (5/9). Αναλυτικά:
3η φάση - 13 Σεπτεμβρίου
1. Αχαρναϊκός-Παναχαϊκή
2. Πανθρακικός-Εθνικός
3. Ζάκυνθος-Νίκη Βόλου
4. Χανιά-Απόλλων Πόντου
5. Αιολικός-Αναγέννηση Καρδίτσας
6. Χανιώτη-Τηλυκράτης
7. Παναργειακός-ΠΑΟ Βάρδας
8. Ιωνικός-Καλλιθέα
9. ΟΦ Ιεράπετρας-Καμπανιακός
10. Απόλλων Παραλιμνίου-Αλεξανδρούπολη
11. Μακεδονικός-Αιγάλεω
12. Κοζάνη-Ηρακλής
13. Ηλιούπολη-Λεβαδειακός
14. Αστέρας Σταυρού-Γιούχτας
Στην 4η φάση άνευ αγώνα προκρίθηκαν οι Διαγόρας Ρόδου, Μικρασιατικός Αστέρας, Πιερικός, Αλμωπός Αριδαίας, Καλαμάτα και ΑΕΛ.
4η φάση - 27 Σεπτεμβρίου
15. Νικητής 12 - Νικητής 4
16. Καλαμάτα-Νικητής 8
17. Νικητής 3 - Νικητής 7
18. Πιερικός - Νικητής 1
19.Μικρασιατικός - Νικητής 10
20. ΑΕΛ - Νικητής 6
21. Νικητής 11 - Διαγόρας Ρόδου
22. Νικητής 2 - Νικητής 14
23. νικητής 13 - Νικητής 5
24. Αλμωπός Αριδαίας- Νικητής 9
5η φάση - 7/8 Οκτωβρίου
Νικητής 18 - Κηφισιά
Νικητής 22 - Ατρόμητος
Νικητής 21 - Παναιτωλικός
Νικητής 23 - Λαμία
Νικητής 15 - ΟΦΗ
Νικητής 19 - Πανσερραϊκός
Νικητής 24 - Αστέρας Τρίπολης
ΠΑΣ Γιάννινα - Βόλος
Στην 6η φάση πέρασαν χωρίς αγώνα οι Νικητής 16, Νικητής 17 και Νικητής 20.